老師好，我是建筑公司乙方，承接甲方的市政道路工程，現在已經全部完工。在當時施工過程中，乙方對于道路周邊的綠化帶未能及時恢復原貌，甲方找了第三方的施工隊做了綠化帶恢復，總價款37萬元，甲方要求我方支付37 萬元，乙方也同意支付，但是截止目前，甲方還欠乙方工程款7萬元，因為甲方付款不及時，乙方說支付30萬給甲方，7萬元不走賬，雙方債權債務兩清。請問老師這樣操作可以嗎？雙方的發票如何開具？

老師 我們是房開企業 跟建筑方乙方個人也就是實際控制人簽的建筑施工合同（只是主體建設）合同單價是一千對一平方，但是接著以我們甲方和建筑公司乙方又以2千多每平方單價報給相關住建部門備案（我估計當時是為了增加開發成本這樣做的，并且建筑方的承包內容還是主體和基樁部分）現在甲乙雙方為了把單價提高就將甲方的部分工程讓給乙方承包了，到時候甲方要結算給乙方的，那么要怎樣操作比較合規呢？是否需要對報給住建部門的合同進行補充合同承包內容呢？我們公司對以后土增稅清算需要做足哪些補充事項保證是合規的呢？還有這樣有沒有什么風險？

以下為真實事件： 有甲，乙兩公司。甲公司賣給乙公司總價10萬元的財務管理軟件，且在合同上注明，此價不含稅。乙公司自19年付款5萬元（其中3萬元為公對公，2萬元為私對私），余款至今未付。 22年，現階段，乙公司內部出現運營問題，已經在走清算破產流程。本來以方不愿意付余下5萬，但乙方破產清算小組，需要從甲方拿到財務管理軟件密碼，因此，同意給向甲方付清剩余款項。 問題1、甲方在乙方破產過程當中，有直接或潛在的法律（比如稅務）風險嗎？ 問題2、甲方在乙方經濟糾紛中，會被稅務、工商機關，追查稅務、票務問題嗎

以下為真實事件： 有甲，乙兩公司。甲公司賣給乙公司總價10萬元的財務管理軟件，且在合同上注明，此價不含稅。乙公司自19年付款5萬元（其中3萬元為公對公，2萬元為私對私），余款至今未付。 22年，現階段，乙公司內部出現運營問題，已經在走清算破產流程。本來以方不愿意付余下5萬，但乙方破產清算小組，需要從甲方拿到財務管理軟件密碼，因此，同意給向甲方付清剩余款項。 問題1、甲方在乙方破產過程當中，有直接或潛在的法律（比如稅務）風險嗎？具體是什么風險？ 問題2、甲方在乙方經濟糾紛中，會被稅務、工商機關，追查稅務、票務問題嗎？具體是那些方面的問題？ 問題3：乙方在清算期間，是否有償還債務的義務，甲方是否有權追討剩余款項？ 問題4：剩余款項，如果乙方對公支付的情況下，甲方是否有權要求其補交稅額呢？

問一個實際業務，甲方（商貿公司）和乙方（建筑公司）簽了10萬元的建筑合同，因為建筑施工問題甲方罰了乙方5千元，工程完畢甲方在工程款里減出來5千元，直接支付乙方9萬5千元，乙方應該給甲方開具10萬元發票，還是9萬5千元發票？分錄怎么做呢？